Ciao,
che distribuzione usi (e che repository)? La versione CVS non deve essere patchata.
Perché avvii l'autogen? IMHO non serve (io non l'ho mai usato ed ho sempre compilato senza problemi).
Posta gli errori del configure altrimenti è difficile cercare di capire cosa va storto.
P.S. Devo per caso installare le wxWidgets (ovvero tutte : base, gtk, etc...) ?
Non so risponderti di preciso... io ho installato queste (ma non so se tutte sono necessarie):
debian:~$ dpkg --get-selections | grep wx | grep 2.8
libwxbase2.8-0 install
libwxbase2.8-dev install
libwxgtk2.8-0 install
libwxgtk2.8-dev install
wx2.8-headers install
Ciao.
PS: se non l'avessi visto:
http://www.amule.org/wiki/index.php/HowTo_Compile_In_Debian