lxuser, los paquetes .deb del aMule CVS 2.20 estan construidos de una forma diferente a los de los repositorios de Ubuntu.
Mientras que en los repositorios de Ubuntu dividen el aMule en 4 paquetes, yo lo concentro en uno entre otras cosas por que es más sencillo y practico de distribuir.
El problema es que si intentas actualizar el aMule 2.13 instalado con uno de esos paquetes te dara error, por lo que como bien dice en el post:
Note: You must remove all the packages you have installed before aMule since it could give you problems when you try to install this.
Tienes que desinstalar todos los paquetes del aMule que hayas instalado.