Hola, yo tambien soy novatilla.
Si tienes contraseña de root, date permisos en esa carpeta y luego podras arrancar el amule. Una vez arrancado, si quieres, pones la carpeta temp en otra ubicacion, y luego vuelves a dar los permisos originales en la otra carpeta q cambiaste para dejarlo todo tal y como estaba antes.
Aunque borres amule y vuelvas a instalar, los archivos de configuracion se siguen manteniendo en el directorio $HOME de tu usuario. Si quieres resetearlo todo, mas que borrar el amule, deberias borrar el directorio .aMule de $HOME de tu usuario, y asi, la siguiente vez que arranques amule, volvera a generarlo todo otra vez desde 0.
Espero que esté en lo correcto y sea de tu ayuda. Suerte