Hallo schabau,
man kann emulecollection-Dateien in aMule unter "Freigegebene Dateien" per Rechtsklick auf eine Collection-Datei und der Auswahl der entsprechenden Option im Menü hinzufügen.
Ich weiß nicht, ob dies auch unter aMuleGUI funktioniert, die Option wird für aMule zumindest nur für Dateien mit der Endung ".emulecollection" angezeigt.