Veja isto:
http://forum.amule.org/thread.php?threadid=4619&sid=Sim e possivel atraves do amulecmd pode mudar velocidades,ver as estatisticas,ligar a outro servidor,pausar os ficheiros(ainda k so suporte pausar todos e resumir todos),descarregar os ed2k links na linha de comando...etc...etc...
Repare nos posts do geeko a falar do amulecmd
Sim o windows pode rodar ssh atraves do software que uso o securecrt...basta procurar no google....
Se o seu servidor tem ambiente X pk nao instala o vncserver e se liga ao X do seu server do seu windows ou de um outro linux?Não precisa ter monitor....alias...tenho 3 makinas num outro lugar que acedo remotamente ao X e ainda tenho outra sem X k faço tudo com o amulecmd e atraves do webserver(olhe k e um pentium 120 com 64 Mb de ram)e aguenta mto bem o amuled(amule-daemon)....
Por isso imagine o k fazer com isso tudo....

Cheers...