es posible que tengas los archivos temporales en una particion de windows (fat32 por ejemplo) y los cargues desde ahi, el error se daria si tenias una version anterior instalada e instalas la actual encima o si ya has arrancado antes el amule.
Para que arranque lo unico que tienes que hacer es borrar el archivo .aMule (OJO, el archivo, no el directorio) de tu directorio home/loquesea y arrancara, pero al volver a ponerlo volvera a cascar.
Trasteando un poco he descubierto que el problema de algun modo tiene que ver con usar un directorio determinado o una particion determinada para los archivos temporales asi que pasamos a la practica por orden (lo que yo he hecho, seguramente haya mas maneras de hacerlo).
1) borra el ARCHIVO .aMule del directorio /home/talycual <-- tu directorio home vamos...
2) entra en el DIRECTORIO .aMule borra los direcotorios incoming y temp (o renombralos si no quieres perder algo que tengas en ellos) y crea enlaces a los directorios donde tienes los archivos temporales y bajados en la otra particion
3) arranca el aMule y dile que busque los archivos en esos enlaces
4) disfruta
Puede que te de errores de permisos para escribir los archivos .part.temp.bak, simplemente ignoralos hasta que salga una version que arregle estos fallos.