Ummm, esto entonces es más complicado, principalemente porque estamos hablando de un OS que no domino.
Prueba lo siguiente. Yo en mi path de usuario (/home/usuario) tengo un directorio que es .mozilla/firefox/qwzmm152.default
Dentro de este, encuentro un archivo que es prefs.js
Si lo abres con un editor de texto, con Firefox cerrado, te encontraras las preferencias de usuario.
Añade respetando el orden alfabético las siguientes secuencias
user_pref("network.protocol-handler.app.ed2k", "/usr/local/bin/ed2k");
user_pref("network.protocol-handler.external.ed2k", true);
Si además quieres que Firefox no te avise de que va a recurrir a una aplicación externa para lanzar los e-link, puedes añadir:
user_pref("network.protocol-handler.warn-external.ed2k", false);
PD: Todo lo que aparece en cursiva son datos que pueden variar, dependiendo del caso.
PD2: Veo que has creado un nuevo post también para el tema de eliminar los archivos añadidos por error. Te repito que crear post de forma incesante no ayuda ni mucho menos a que te solucionen el problema, principalmente porque cuando uno contesta a un post, si así lo desea, puede recibir un correo cuando hay nuevas contestaciones, y así seguir el tema hasta que esté solucionado. De la otra forma, cuando creas uno, si pasa alguien lo lee, y si no, pues pasa todo el mundo de contestar. Por favor, manten el hilo del post y no sigas creando cada vez que quieras añadir algo.