Normalmente eso no deberia pasar. aMule 2.0 es bastante estable. A mi normalmente se me muere antes KDE que aMule

Probablemente estes usando una version de wx incompatible con tu version de gtk. esalgo muy tipico de las distros "orientadas a desktops". No le dan tanta iomportancia a la estabilidad como a l aapariencia y sencillez de uso. Seguramente usas GTK2 con wx 2.4 o con un wx 2.6 no parcheado para usar GTK2 correctamente. O quizas es otra cosa.
Deberias usar un script que te reiniciara aMule al colgarse y detectara cuelgues. Mira por los foros, hay varios por ahi. si no encuentras ninguno que te sirva, te pueso pasar el mio.
un saludo!