Ciao,
semplicemente non mettere in share tutta quella roba, posso supporre che amule si impianti nel momento in cui calcola gli hash di tutti i file.
La quantità di file in share non influenza l'ID. L'id può solo essere o alto o basso, tra due id alti non c'è alcuna differenza (e alto e basso dipende solamente dalle impostazioni di rete).
Per una miglior efficenza entrano in gioco i crediti che guadagni uploadando, ma per questo è meglio mettere in share pochi file ma buoni (generalmente file della stessa tipologia di quelli che poi hai intenzione di scaricare), piuttosto che una miriade di file.
Ciao.