Varias opciones:
*Seguir en la versión anterior del aMule
*Ensuciarte las manos y probar a empaquetar tu propio aMule (no es tan dificil, yo lo hice durante una temporada)
*Esperar a la nueva versión de Ubuntu (cuantas veces habré dicho eso

) y rogar para que algún buen samaritano actualice el aMule de los repos de Ubuntu.