Imagino que no tienes ningún servidor en la ventana de servidores... además, si no estoy equivocado, en 1.2.6 lo de actualizar servidores no funcionaba. Solución: coge el server.met de eMule y ponlo en ~/.amule/ substituyendo al anterior.
Si no puedes conseguir ningun server.met o te da pereza, o lo que sea, instalate el aMule 2.0.0rc3 que es menos estable que 1.2.6 (es una versón de testing) pero es más rapido, con más features, mas eMule compatible, mas molón, más guapo y más mejor. RC3 no te dará problemas con los servers.
Si no te quieres arriesgar con versiones RC, bajate "manualmente" este archivo
http://www.srv1000.com/azz/server.met y ponlo en ~/.aMule/ como te he dicho antes.
Eso debería servite ;-)
Un saludo.