Pues retomo el tema y lo confirmo, en otro fs (ufs2 para ser exactos), no hay ningún problema.
No se muy bien si el motivo del error era que estaba en una unidad USB, que era Fat32, o todo junto, pero ahora que los temporales están en el disco duro interno, con UFS2 no veo ni por asomo esos valores de corrupción, y la compresión funciona mucho mejor (o por lo menos ahora se deja notar).
