Estaban haciendo cambios importantes a nivel de núcleo en amule, supongo que para que sea compatible con el emule 0.47a (cosas como ficheros de + de 200Gb...)
Hasta nueva orden, está el aviso de que la versión CVS es muy inestable, nada te impide intentarlo.
Sobre como hacer un .deb, ni idea, pasate por los foros de debian, ahà será más fácil que te respondan.
PD. ¿Porque veo caracteres extraños cuando salen letras con tildes o "enyes"?