¿Por qué utilizas a root?
Te aconsejo que lo olvides, usalo sólo para administrar.
Ese mensaje lo encontraras en muchas aplicaciones.
Tienes que olvidarte de root, y encargarte de que root te conozca como usuario. Así qualquier alteración pasa por tus manos y con tu permiso. (como root todo, todo es permitido)
Echale un vistazo al codigo fuente, con los buscares que hay, seguro que te cuesta poco encontrar la referencia en algo similar a system UID=0