Und das heißt ... ? Derselbe Fehler kann's ja nicht mehr sein, nachdem das Verzeichnis "docs" rausgepatcht ist.
Den Fehler würde ich aber sowieso auf alle Fälle bei checkinstall suchen. Grob gesagt funktioniert checkinstall, indem es Systemaufrufe, die das Dateisystem modifizieren (Dateien oder Verzeichnisse anlegen, ändern, löschen etc.), abfängt, umleitet und aus diesen Informationen ein Paket baut. Das scheint nach einem Systemupgrade nicht mehr zu funktionieren (auf meinem openSUSE-Factory-System scheitert es übrigens mit derselben Fehlermeldung, gerade getestet); ich vermute eine Inkompatibilität mit der neuesten glibc.